En conformité avec les normes internationales pour la pratique professionnelle de l’audit interne, la fonction d’Audit interne du Conseil de l’Europe a été soumise à une évaluation externe de la qualité (EEQ) pendant la seconde moitié de l’année 2022. L’EEQ a été réalisée par l’Institut Français de l'Audit et du Contrôle Internes (IFACI), la branche française de l’Institute of Internal Auditors (IIA) : « La Division de l’Audit interne (AI) de la Direction de l’Audit interne, de l’Évaluation et de l’Investigation (DIO) du Conseil de l’Europe (CdE) est « Globalement Conforme » aux dispositions obligatoires du Cadre de référence international des pratiques professionnelles (CRIPP), composé des principes fondamentaux pour la pratique professionnelle de l’Audit interne, du Code de déontologie et de la définition de l’Audit interne, et communément appelés « les Normes » de l’Institut des Auditeurs internes (Institute of Internal Auditors – IIA). « Globalement Conforme » est la notation la plus élevée parmi les trois notations possibles.

De plus, la division de l'Audit interne entretient des contacts réguliers avec des services similaires d'autres organisations internationales, en particulier avec l'OCDE, Interpol, le CERN, l'OTAN, l'UNESCO et les bureaux des Nations Unis à Genève. Ces contacts lui permettent de partager des bonnes pratiques, des outils et des méthodologies.

La fonction d'Évaluation a été analysée par les pairs en 2017 et en 2022 ; plusieurs recommendations ont été émises et mises œuvre depuis. La division de l’Évaluation coopère avec les bureaux de l'évaluation de la Commission européenne et maintient des contacts réguliers avec les délégations de l'Union européenne et autres donneurs représentant les pays dans lesquels les évaluations sont menées.

La division de l'Évaluation est également un membre institutionnel de la Société européenne pour l'évaluation, ce qui lui permet de se tenir informée des développements dans son champ d'intervention.

La fonction d'Investigation est actuellement analysée par les pairs.