L'Observatoire conduit des études thématiques approfondissant certains sujets relatifs à l'enseignement de l'histoire. Le choix des sujets tient compte des priorités du Conseil de l'Europe, ainsi que des questions particulièrement urgentes et pertinentes dans nos sociétés européennes modernes. Ces rapports thématiques sont rédigés par un groupe d'experts, en étroite collaboration avec le Conseil scientifique consultatif (CSC) de l'Observatoire et selon la méthodologie élaborée et approuvée par le CSC.