Le 26 octobre 2023, lors de sa 45e Session à Strasbourg, le Congrès a tenu un débat sur la situation humanitaire suite à la fuite de plus de 100 000 Arméniens du Karabakh vers l'Arménie voisine.
Dans la Déclaration adoptée et présentée par Bernd Vöhringer (Allemagne, PPE/DC), le Congrès a fermement condamné l'opération militaire menée par l'Azerbaïdjan dans le Karabakh les 19 et 20 septembre 2023 et le blocus de la région pendant dix mois l’ayant précédée, qui ont entraîné une situation humanitaire désastreuse. Tout en reconnaissant l'intégrité territoriale de l'Azerbaïdjan, le Congrès a déploré les graves conséquences humanitaires de la situation et a appelé l'Azerbaïdjan à s'abstenir de toute action susceptible d'entraîner une nouvelle détérioration de la situation, et à libérer tous les représentants du Karabakh détenus, y compris au niveau local.
Le Congrès a exprimé sa solidarité avec les autorités locales arméniennes qui accueillent les Arméniens du Karabakh. Il s'est félicité du soutien déjà apporté aux communautés locales par le gouvernement arménien et a affirmé qu’il était prêt à aider les autorités nationales et locales arméniennes à faire face aux conséquences de la situation, notamment par des activités de coopération sur le terrain.